刑事案件处罚金会留案底。因为处罚金是刑罚中的附加刑，被判处罚金意味着行为人被认定构成犯罪，只要构成犯罪就会留下案底。

需要明确案底的定义。案底一般指某人过去犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，该犯罪档案一般存放至公安部门保存。

要了解罚金的性质。罚金是人民法院判处犯罪人向国家缴纳一定数额金钱的刑罚方法，属于刑罚体系中附加刑的一种。附加刑是补充主刑适用的刑罚方法，既可以附加于主刑适用，也可以独立适用。这表明，当法院对犯罪人判处罚金时，是基于其犯罪行为作出的刑事处罚。

根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，刑罚分为主刑和附加刑。主刑包括管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑和死刑；附加刑包括罚金、剥夺政治权利、没收财产等。只要被判处了刑罚，无论是主刑还是附加刑，都意味着行为人实施了犯罪行为，并且经过了人民法院的审判和定罪。

一旦行为人被认定构成犯罪并受到刑事处罚，相关的犯罪信息就会被记录在案。这些记录会被保存在司法机关的数据库中，成为个人的犯罪记录，也就是案底。案底会对个人产生多方面的影响，比如在就业方面，一些特定的职业，像公务员、律师、法官等，通常会对有犯罪记录的人员进行限制；在出国签证办理时，某些国家也可能会因为申请人有犯罪记录而拒绝签发签证。

综上所述，刑事案件处罚金是会留下案底的，因为这是对犯罪行为的一种刑事制裁。

法律依据：

《公安机关办理犯罪记录查询工作规定》 第二条

本规定所称的犯罪记录，是指我国国家专门机关对犯罪人员的客观记载。除人民法院生效裁判文书确认有罪外，其他情况均应当视为无罪。

有关人员涉嫌犯罪，但人民法院尚未作出生效判决、裁定，或者人民检察院作出不起诉决定，或者办案单位撤销案件、撤回起诉、对其终止侦查的，属于无犯罪记录人员。