摩托车闯红灯被轿车撞后，处理流程需遵循现场保护、责任认定、保险理赔及赔偿协商的步骤。通常摩托车因闯红灯违反通行规则需承担主要或全部责任，具体需结合轿车是否存在过错（如超速、未避让等）由交警部门认定。处理时需保留现场证据、及时报警报保险，依据责任划分通过保险或协商解决赔偿问题。

一、现场处理：保护现场并固定证据

事故发生后，双方需立即停车，开启危险报警闪光灯，在来车方向设置警示标志（城市道路50-100米，高速公路150米以上），避免二次事故。严禁擅自移动车辆或破坏现场，尤其是摩托车闯红灯的关键证据（如交通信号灯状态、车辆位置等）需保留。若有人员受伤，优先拨打120急救电话，随后拨打122报警并通知各自保险公司（交强险承保公司需在48小时内报案）。现场可通过手机拍摄事故全景、车辆碰撞部位、交通信号灯、刹车痕迹等照片，作为后续责任认定依据。

二、责任认定：依据交通法规划分责任

交警部门会根据现场勘查、监控录像、行车记录仪及双方陈述等证据，依据《道路交通安全法》第38条（“车辆、行人应当按照交通信号通行”）及《道路交通安全法实施条例》第38条（“红灯亮时，禁止车辆通行”），认定摩托车闯红灯的违法行为是事故主因。若轿车无过错（如正常行驶、未超速、已采取避让措施），摩托车通常承担全部责任；若轿车存在过错（如超速、酒驾、未观察路况等），则需根据过错程度划分责任（如摩托车主要责任、轿车次要责任）。责任认定书出具后，双方需签字确认，对结果有异议可在3日内申请复核。

三、保险理赔：交强险优先赔付，商业险按责分担

1. 交强险赔付规则：轿车方交强险需优先赔付，与责任无关。无责时，交强险医疗费用赔偿限额1800元、财产损失100元、死亡伤残1.8万元；有责时，医疗费用1.8万元、财产损失2000元、死亡伤残18万元。摩托车方损失若超出轿车交强险限额，需由摩托车方自行承担或通过自身商业险（如有）赔付。

2. 商业险赔付规则：轿车商业险（如车损险、三者险）仅在轿车有责时，按责任比例赔付摩托车方损失；若轿车无责，商业险不赔付。摩托车方若投保商业险，自身损失可按责任比例向保险公司申请赔付，但因闯红灯属违法行为，部分保险公司可能拒赔或增加免赔额。

四、赔偿协商：明确项目并依法索赔

责任认定后，双方可协商赔偿事宜，赔偿项目包括医疗费（凭票据）、误工费（按误工时间和收入计算）、护理费（护理人员收入×护理天数）、交通费（实际支出）、车辆维修费（定损单或维修发票）等。协商需基于责任比例，如摩托车全责，需自行承担大部分损失；主次责任则按比例分担（如摩托车70%、轿车30%）。协商一致后签订书面协议，履行赔偿；协商不成可申请交警部门调解（收到责任认定书后10日内提出），或直接向法院起诉（需提交责任认定书、损失证据等材料）。

五、特殊情况处理

1. 摩托车无牌无证：若摩托车未登记或驾驶人无证驾驶，交警会另行处罚（罚款、拘留），且可能因“驾驶无合法手续车辆”加重事故责任。

2. 轿车司机存在过错：如轿车超速50%以上、酒驾、逆行等，即使摩托车闯红灯，轿车仍可能因“严重过错”承担主要责任，需以交警部门最终认定为准。

3. 人员重伤或死亡：若事故造成人员重伤、死亡，需配合交警进行刑事调查（如摩托车方全责可能涉及交通肇事罪），赔偿需优先通过交强险、商业险赔付，不足部分由责任人个人承担。

综上，摩托车闯红灯被撞后，需严格遵循法定流程，以责任认定为核心，通过保险和协商解决纠纷，必要时借助法律途径维护权益。

法律依据：

《中华人民共和国道路交通安全法》 第七十条

在道路上发生交通事故，车辆驾驶人应当立即停车，保护现场；造成人身伤亡的，车辆驾驶人应当立即抢救受伤人员，并迅速报告执勤的交通警察或者公安机关交通管理部门。因抢救受伤人员变动现场的，应当标明位置。乘车人、过往车辆驾驶人、过往行人应当予以协助。

在道路上发生交通事故，未造成人身伤亡，当事人对事实及成因无争议的，可以即行撤离现场，恢复交通，自行协商处理损害赔偿事宜；不即行撤离现场的，应当迅速报告执勤的交通警察或者公安机关交通管理部门。

在道路上发生交通事故，仅造成轻微财产损失，并且基本事实清楚的，当事人应当先撤离现场再进行协商处理。