女方怀孕期间申请离婚，法院判决需以“感情确已破裂”为核心标准，同时结合《民法典》对女方的特殊保护，综合考量双方意愿、子女权益、财产状况等因素。若女方提交的证据足以证明感情破裂且无和好可能，法院会依法判决离婚，并对子女抚养权、财产分割等问题作出有利于女方和胎儿的处理；若感情未破裂或存在和好可能，法院会驳回离婚请求。

首先，需明确法律对女方怀孕期间离婚权利的特殊保护。根据《民法典》第一千零八十二条规定，女方在怀孕期间、分娩后一年内或者终止妊娠后六个月内，男方不得提出离婚；但是，女方提出离婚或者人民法院认为确有必要受理男方离婚请求的除外。这意味着女方在怀孕期间主动申请离婚，法院有权受理，而男方在此期间无特殊情况不得提出离婚，体现了法律对女性生育期间的权益保护。

其次，法院判决离婚的核心标准是“感情确已破裂”。《民法典》第一千零七十九条明确，人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。实践中，女方需提供充分证据证明双方感情已无法挽回，常见情形包括：（一）重婚或者与他人同居；（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；（四）因感情不和分居满二年；（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。例如，若男方存在家暴行为，女方提交报警记录、伤情鉴定等证据，法院调解无效后通常会支持离婚请求；若仅因生活琐事争吵，未达到感情破裂程度，法院可能驳回起诉，给予双方和好机会。

关于子女抚养权与抚养费，若离婚时女方已怀孕，胎儿出生后即享有民事权利能力。根据《民法典》第一千零八十四条，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。因此，孩子出生后抚养权原则上归女方，男方需承担抚养费。抚养费数额一般根据子女实际需要、父母双方负担能力和当地生活水平确定，通常为男方月总收入的20%-30%，直至子女年满十八周岁。即使离婚协议中未约定抚养费，女方仍可在孩子出生后单独主张。

财产分割方面，法院会遵循“照顾子女、女方和无过错方权益”的原则。《民法典》第一千零八十七条规定，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。由于女方处于怀孕特殊时期，可能面临生育、抚养子女的压力，法院在分割财产时会适当向女方倾斜，例如对房产、存款等共同财产，可能判决女方多分份额，或优先分配便于抚养子女的财产（如带学位的房产）。

此外，若男方存在过错行为（如重婚、与他人同居、实施家庭暴力、虐待遗弃家庭成员等），女方可依据《民法典》第一千零九十一条主张损害赔偿。赔偿范围包括物质损害（如医疗费、误工费）和精神损害抚慰金，具体数额需结合过错程度、损害后果等因素确定。

综上，女方怀孕期间申请离婚，法院会严格依据法律规定，以“感情确已破裂”为基础，结合子女权益、财产状况及双方过错等因素综合判决。女方需注意收集感情破裂、男方过错、自身经济困难等相关证据，以最大限度维护自身及胎儿的合法权益。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。