员工诈骗公司，可通过向公司内部相关部门反映、向公安机关报案、向行业监管部门举报等方式进行举报。

若发现员工诈骗公司，可以选择向公司内部相关部门反映情况。公司一般设有法务部门、审计部门或者人力资源部门等。法务部门熟悉法律流程，能够从法律层面分析该事件，为后续处理提供专业的法律建议；审计部门可以对涉及的财务账目等进行详细审查，确定诈骗行为造成的经济损失等情况；人力资源部门则可以从员工管理的角度，对涉事员工采取相应的措施，如暂停其工作等。向公司内部反映时，要准备好相关的证据，如聊天记录、文件资料、财务报表等，以便公司更全面地了解情况。

向公安机关报案是非常重要的途径。员工诈骗公司的行为可能涉嫌诈骗罪等刑事犯罪。根据《中华人民共和国刑法》规定，诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。在报案时，要清晰准确地向警方陈述诈骗行为发生的时间、地点、经过等情况，提供尽可能多的证据材料。公安机关会根据具体情况进行立案侦查，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

如果该诈骗行为涉及特定行业的监管问题，还可以向行业监管部门举报。例如，如果是金融行业的员工诈骗公司，可向银保监会等相关监管机构举报。行业监管部门能够从行业规范和监管的角度，对该事件进行调查和处理，维护行业的正常秩序。

在整个举报过程中，要注意保护自身安全，避免受到涉事员工的打击报复。同时，要积极配合相关部门的调查工作，如实提供信息，以确保诈骗行为得到应有的惩处，公司的合法权益得到维护。

法律依据：

《中华人民共和国刑法》 第二百六十六条

诈骗公私财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。本法另有规定的，依照规定。