农村房子办房产证主要是为了明确房屋产权归属、保障合法权益、便于房屋流转以及利于获得政策支持。

明确房屋产权归属是办理房产证的重要意义之一。房产证是房屋所有权的合法凭证，有了它，能够清晰地界定房屋的归属。在农村，随着人口的流动和家庭结构的变化，房屋的产权问题可能会变得复杂。有了房产证，就可以明确该房屋归谁所有，避免家庭成员之间、邻里之间因房屋产权不清晰而产生纠纷。比如，在一些家庭中，子女众多，在父母去世后，如果没有房产证明确房屋产权，就可能会因为房屋的继承问题引发矛盾。

保障合法权益是关键。房产证是对农民房屋合法权益的有力保障。在面临征地拆迁等情况时，有房产证的房屋所有者能够依法获得合理的补偿。如果没有房产证，农民的房屋权益可能得不到有效的保障，在拆迁补偿谈判中也会处于不利地位。例如，在一些农村地区进行基础设施建设时，需要征收部分房屋，如果房屋没有房产证，农民可能无法获得应有的补偿，自身权益受到损害。

便于房屋流转。办理房产证后，农村房屋的流转变得更加规范和顺畅。农民可以将房屋进行抵押、出租、转让等。这对于盘活农村资产、增加农民收入具有重要意义。比如，一些农民想要创业，但缺乏资金，有了房产证，就可以将房屋进行抵押，获得银行贷款，用于发展产业。同时，规范的流转也有利于农村房地产市场的健康发展。

利于获得政策支持。有房产证的农村房屋更容易获得相关政策的支持和补贴。政府在进行农村危房改造、新农村建设等项目时，通常会以房产证作为重要的依据。有房产证的房屋所有者能够更顺利地申请到相关的政策扶持，改善居住条件。例如，在农村危房改造项目中，有房产证的农民可以按照规定获得相应的改造资金补贴，对房屋进行修缮和重建。

法律依据：

《中华人民共和国城市房地产管理法》 第六十条

国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度。

《中华人民共和国民法典》 第二百零九条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。

《中华人民共和国民法典》 第二百一十四条

不动产物权的设立、变更、转让和消灭，依照法律规定应当登记的，自记载于不动产登记簿时发生效力。