离婚时一男一女两个孩子抚养权的判决需综合多方面因素，通常会按照最有利于未成年子女的原则。可能会判决一方抚养一个孩子，也可能两个孩子都判给一方，具体要依据父母双方的实际情况判定。

在司法实践中，法院对于离婚案件中孩子抚养权的判定遵循的核心原则是最有利于未成年子女。首先会考虑孩子的年龄。根据法律规定，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。如果两个孩子中有不满两周岁的，大概率会判给母亲抚养。比如，若女孩未满两周岁，男孩已超过两周岁，那么女孩可能会判给母亲，男孩的抚养权则要结合其他情况进一步判断。

对于已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，法院会综合考虑双方的具体情况。这包括父母双方的经济状况，稳定且良好的经济条件能够为孩子提供更好的生活和教育资源。例如，一方有稳定的高收入工作，能为孩子提供优质的居住环境、教育条件等，在争取抚养权上会更有优势。还会考虑双方的生活环境，包括居住地点周边的教育、医疗等配套设施是否完善。

父母双方的个人品德、生活习惯等也在考量范围内。若一方存在不良嗜好，如赌博、酗酒等，可能会影响孩子的身心健康，法院一般不会将抚养权判给这一方。

已满八周岁的子女，应当尊重其真实意愿。如果两个孩子都已满八周岁，法院会单独询问他们愿意跟随哪一方生活，并将其意愿作为重要的参考因素。不过，这并不意味着完全按照孩子的意愿来判决，还要结合其他条件综合判断。

在实际判决中，为了平衡双方的权益和孩子的成长，很多情况下会判决一方抚养一个孩子。但如果一方存在不适合抚养孩子的情形，如患有严重疾病、长期无法照顾孩子等，法院也可能会将两个孩子都判给另一方抚养。法院会从各个方面综合考量，以确保孩子能够在健康、稳定的环境中成长。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。